Od vpádu Oročimarua do Konohy a Sasukeho úteku uplynuli už viac ako dva roky. Naruto sa so svojím majstrom po náročnom tréningu vracia do rodnej dediny a zisťuje, že ani ostatní nezaháľali. Každý z bývalých študentov nindža akadémie ušiel veľký kus cesty a sú dnes neporovnateľne silnejšie ako predtým. Lenže nie sú sami. Ani tajomní Akacuki nezaháľali a zdá sa, že ich starostlivo pripravovaný plán sa blíži vyvrcholeniu. Kdesi v tajnom úkryte navyše Oročimaru pokračuje v prípravách na ovládnutie Sasukeho tela…